Pembiasaan di MASEDA dimulai dihari Senin yaitu Upacara Bendera. Setiap Madrasah diharuskan melaksanakan Upacara Bendera dihari Senin, karena untuk menghormati jasa-jasa para Pahlawan yang telah gugur demi memperjuangkan Kemerdekaan Republik Indonesia ini

dengan adanya Upacara Bendera ini bisa melatih Siswa/siswi Madrasah dalam menghormati jasa-jasa para Pahlawan dan mendapatkan ilmu kedisiplinan maupun lainnya.